Boa Tarde;
A loja só precisará emitir Nota Fiscal Eletrônica caso a pessoa física ou jurídica que efetuar a compra solicitar a NFe, caso não exija não há necessidade.
Caso queira emitir a NFe, o processo é atravéz de algum programa fornecido por empresas que desenvolvem esses tipos de programa, onde no programa vem incluso sistemas para controle de estoque, lançamento de NFe de entrada e também a NFe de saida (que é a que precisaria caso o comprador solicite.)
Na minha região, a empresa que disponibiliza esses programas é a Diamante Sistemas, mas caso precise, procure uma empresa na sua região.
A emissão da Nota é simples;