Bom dia!!
Com relação a uma possível fiscalização sobre as notas, se acaso ocorrer, vai ser acionado o cliente... e ele vai ter que levantar seu arquivo de notas, para atender a fiscalização.
Com tudo, o ideal seria ele lhe apresentar as notas originais, sendo assim o risco de "informações divergentes" cai drasticamente, evitando possíveis problemas futuros vinculando seu escritório.
Por favor, solicito aos colegas contadores, que informem se existe alguma norma/lei que determine a obrigatoriedade da apresentação das notas originais do cliente ao contador. ...
Espero ter ajudado!