Diferencial de Aliquota

Prezados Contadores,
Trabalho em uma empresa inscrita no ICMS do Rio de Janeiro e assinamos contrato com algumas empresas prestadoras de serviços de internet, telefonia, banda larga etc. No momento do faturamento, a empresa emitiu o documento fiscal no CNPJ da filial, que por acaso é também do RJ e a matriz em MG. Minha duvida é se este procedimento esta correto, pois o documento fiscal esta diferente do contrato e desta forma não estou recolhendo o Diferencial de Alíquota do ICMS.
Agradeço a ajuda.

Sérgio Araujo de Souza,

Nesse caso não há problema se o seu fornecedor esta emitindo NF de uma filial, sendo que o contrato foi firmado pela Matriz da empresa.
O que você tem que observar é se o CNPJ raiz, ( 8 primeiro dígitos ) é o mesmo que o da empresa que assinou contrato.