Icms S.t.

Bom dia a todos.
gostaria de saber o processo correto para a seguinte situação :
eu trabalho em uma empresa da qual tem o costume de bonificar alguns clientes, em virtude disso saiu uma bonificação para um cliente.
só que na hora de lançar este pedido de bonificação saiu com uma CFOP errada, da qual não calculava o valor correto da S.T. a recolher.
porém na NFe saiu um valor de S.T. a menor do que deveria sair e por um erro de sistema nós recolhemos um valor a maior do que saiu na nota e a menor do que realmente deveria recolher. EX:. na NFe saiu o valor da S.T. de R$ 1.000,00 e nós recolhemos R$ 1.100,00, porém o correto a ser recolhido seria de R$ 1.200,00.
Até ai tudo bem, fizemos uma Nota complementar de S.T. no valor que faltou referente a Nota de bonificação que no caso deste exemplo seria uma Nota de R$ 200,00, e recolhemos uma guia no valor de R$ 100,00 que é a diferença da qual já tínhamos recolhidos para o que deveria realmente ser recolhido. Sendo que nessa Guia de R$ 100,00 coloquei o n° da Nota de Bonificação e não da Nota complementar pois a nota complementar é um complemento de valor referente a nota original de bonificação. Enfim até que ponto eu fiz certo e até que ponto a Receita não aceita essa guia com o nº da nota original e não com o n° da nota complementar ?
aguardo ajuda. obrigado .