Iss retido Pagamento da NF cheio

Boa tarde!!
Amigos estou com uma duvida... Uma empresa que esta em Cotia / SP prestou serviço em outro municipio (Tomador Prefeitura) Serviço 7.02 serviço de construção civil, o prestador efetuou a retenção do INSS 3,5 % e o ISS pois o serviço foi prestado no municipio do tomador, ate ai tudo bem, o problema e que a prefeitura pagou o valor da NF cheio ou seja a obrigação do recolhimento ficou para o prestador, quanto ao INSS tranquilo consigo gerar sem problemas ja o ISS que esta me causando dor de cabeça pois não ha como eu emitir uma guia do ISS avulsa no municipio de Cotia e ai esta sobrando este valor a mais do ISS, oque fazer?

Caro Nathan Gazola

Pelo que entendi o município em questão é de Cotia, e somente a prefeitura desse município poderá resolver seu problema. Terá de entrar em contato com o departamento de fiscalização de Cotia e expor seu caso.

Obrigado, mas meu problema nao é com Cotia pois o serviço foi prestado e retido ISS em Ilha Comprida.. e agora?

Caro Nathan Gazola

O mesmo procedimento.

Somente a prefeitura desse município poderá resolver seu problema. Terá de entrar em contato com o departamento de fiscalização de Ilha Comprida e expor seu caso.
Provavelmente eles irão emitir uma guia para vc recolher o ISS.

Ok, obrigado!