Importação por conta e ordem - Simples Nacional

Boa tarde, estou em SP e fiz uma importação por conta e ordem via trading company. A trading tem matriz em SP e filial em RO. Acontece que o desembaraço do produto é feito aqui em SP mas a nota de remessa vem pra mim com o cnpj da filial RO. Eu, sendo comércio varejista optante pelo simples nacional, tenho que recolher o diferencial de alíquotas? Como faço calculo da ST? na entrada do produto no meu estoque ou na saida da mercadoria?