Bom dia Andrey!
01 - Vou desenvolver uma linha de raciocínio q talvez lhe ajude: Empresa A faz uma compra de mercadoria da Empresa B que por sua vez efetuou uma venda;
1.1 - Caso a Empresa A for fazer a devolução desta compra, a mesma deverá ser feita pela emissão, por parte da Empresa A de uma NFe de Saida, tendo como destinatário a Empresa B e obrigatoriamente a Natureza da Operação: "Devolução de Venda de Mercadoria", escolhendo CFOP 1202 para dentro do estado ou CFOP 2202 para fora do estado;
1.1.1 - Estas mesmas configurações de CFOP, precisam ser feitas no seu programa do FISCAL, senão voce consegui emitir a NF mais não vai conseguir escriturar;