Emissão sem CNAE- de serviço

Bom dia a todos.

Preciso muito de um auxilio. Uma empresa com CNAE -( 46.72-9-00 ) - Comércio atacadista de ferragens e ferramentas.
Pode emitir nota da prefeitura sem CNAE de conserto? 
Nossa contabilidade disse que estamos corretos.
Porém me veio o questionamento, se nosso CNAE e apenas de comercio, como emitimos nota de serviço da prefeitura.

Poderiam me sanar está duvida. Isso na Prefeitura de SP.

Acredito que o próprio site ou sistema da prefeitura onde você emitirá as notas irá barrar, digo isso pois um cliente recentemente tentou emitir uma nota de serviço porém ele só tem CNAE de comércio. O próprio site da prefeitura recusou a emissão da nota.