Venda por conta e ordem em produto industrializado em armazém terceiro.

Estamos com uma certa dificuldade em atender um cliente que necessita que o produto saia com notas de remessa por conta e ordem devido sua revenda.

Cenário:
Empresa (Dona do produto) situada no MT
Armazém (Industrializador) situado no PA
Cooperativa (Quem comprou o produto) situado no MT
Cooperado (Quem vai receber o produto) situado no MT

O produto já se encontra no armazém industrializador com CFOP 6901 (por ser fora do estado) para remessa para industrialização.

Aqui começa o problema, pois existe do armazém um retorno simbólico de produto utilizado em industrialização e também uma nota de remessa por conta e ordem de industrialização destinado ao cooperado.
E minha empresa emite a nota de venda para a cooperativa e também emite uma nota de remessa por conta e ordem para o cooperado.

Aqui temos um problema em que o cooperado recebe duas notas de remessa e acaba gerando muitas dúvidas no que devemos fazer ou se existe outro desenho fiscal mais preciso para esta operação.