Bom dia Otávio
O valor do frete quando por conta do remetente, inclui-se na base de cálculo do ICMS, conforme artigo 37, §1° item 2 do RICMS. Assim, os benefícios de redução de base de cálculo, reduz toda a base de cálculo com todas as inclusões legais.
"Incluem-se na base de cálculo:
...2 - frete, se cobrado em separado, relativo a transporte intramunicipal, intermunicipal ou interestadual, realizado pelo próprio remetente ou por sua conta e ordem"
E então se você verificar o Anexo II que tem os produtos sujeito a Redução são expressos as bases de cálculos, como por exemplo o art. 3º.
"Artigo 3° - (CESTA BÁSICA) - Fica reduzida a base de cálculo do imposto incidente nas operações internas com os produtos a seguir indicados, de forma que a carga tributária resulte no percentual de 7% (sete por cento)"
Espero ter ajudado!