Irapuã,
as notas fiscais eletrônicas devem gradualmente substituir as notas fiscais modelo 1, até o momento existe um cronograma estabelecido que pode ser acompanhado no site da SEFAZ SP no assunto NFe. As demais empresas não enquadradas até o momento ainda continuam emitindo a modelo 1 ( seja em totalidade ou parcialidade - NFE e Mod 1, depende do tipo de transação da empresa)
Existem diversos tipo de Certificados digitais, você tem que adequar o tipo à sua realidade, em sua maioria são "tokens" tipo A3, mas existem cartões, A1 e A3, etc, visite o : http://www.certisign.com.br/produtos-e-servicos/certificados-digitais/nf-e , e obtenha mais sucesso na sua resposta. Para solicitar o credenciamento à emissão de nota fiscal eletrônica visite o : https://www.fazenda.sp.gov.br/nfe/credenciamento/credenciamento.asp , mas lembre-se uma vez credenciado, não pode voltar para o modelo 1, não existe revogação , a não ser por extinção de atividade
Att..
Mazzetto