Integração de Filial

Boa tarde!

A empresa em que trabalho está integrando uma empresa adquirida no sistema Datasul como Filial. Até o momento a empresa comprava a matéria-prima na Usina com entrega conta e ordem nesta "filial" (que realiza um processo de corte antes de envia-la para matriz) pois, até então, tratava-se de um terceiro. A mudança está prevista para 1º de agosto e até agora não conseguimos definir qual(is) o(s) melhor(es) processo(s) para tratarmos esta compra de matéria-prima. O grande problema é que o faturamento continuará na matriz como é hoje e, assim sendo, o custo da matéria-prima deve ser pago pela mesma. Já imaginamos algumas situações, como a que descreveremos abaixo. Gostaria que se alguém já passou por uma situação parecida ou conheça a melhor forma (legal) de tratarmos tal situação que nos contate.

1ª Opção: Matéria-prima faturada diretamente para filial que a processará e transferirá posteriormente para matriz com o preço formado da seguinte maneira: Preço da MP + Preço do corte. (OBS: Acreditamos que pelo volume de movimentações a empresa será penalizada pelo elevado valor de imposto (ICMS) pago nas transferências).

Desde já agradeço!