Sergio Gabriel Sampaio Sousa,
Boa tarde!
Pelo que eu entendi das suas postagem, você está com um cliente que fez a DIRPF e, a declaração cai na malha fina por omissão de receita de um dos dependentes.
Se for isto mesmo, já tenha em mente que o seu cliente, mesmo que esteja com os pagamentos do IRPF declarado em dias, os fez em valor menor do que realmente deveria e, por consequência, deverá recolher a diferença.
Desta forma, você deverá retificar sua declaração e, deverá, ou informar os rendimentos do dependente, que foram omitidos; ou excluir este dependente da DIRPF de seu cliente.
Em qualquer uma das opções, certamente acarretará em uma valor do IRPF maior do que já pago. Sendo assim, você fará a retificação com a mesma quantidade de parcelas da declaração original e, recolher as parcelas com os valores das diferenças, acrescidas dos encargos pelo atraso no pagamento.