Base de calculo do PIS/COFINS - abatimento do ICMS no retorn

Meu nome é Marcelo, sou analista de uma empresa de lucro real. Recebi uma nota de retorno de beneficiamento de SP, com destaque de ICMS s/ a sucata devolvida (CFOP 5124). Ao efetuar o calculo do PIS/COFINS para pagamento, usei o credito referente a está industrialização, porém abata da base o valor do ICMS informado sobre esta sucata. Gostaria de saber se isto está correto, porque segundo meus cálculos estou pagamento o imposto a maior, já que diminuo minha base de calculo dos créditos usados?