Aline,
Pela sua exposição, parece que a tua empresa se enquadra, parcialmente, nos atos cooperativos.
Atos cooperativos são as atividades relacionadas com os cooperados (recebimento do leite).
Atos não-cooperativos são as atividades da cooperativa com os terceiros (venda do leite a não associados, ou seja, terceiros)
O IRPJ/CSLL incide sobre os atos não cooperativos, pois se trata de renda tributável.(arts. 85, 86 e 88 da Lei nº 5.761, de 1971)
A partir de 1º de janeiro de 2005, as sociedades cooperativas que obedecerem ao disposto na legislação específica, relativamente aos atos cooperativos, ficam isentas da Contribuição Social sobre o Lucro Líquido – CSLL (arts 39 e 48 da Lei nº 10.865, de 2004).
A isenção de que trata o art. 39 da Lei nº 10.865, de 2004, não se aplica às sociedades cooperativas de consumo de que trata o art.69 da Lei nº 9.532, de 10 de dezembro de 1997 (parágrafo único do art. 39 da Lei nº 10.865, de 2004).
Sugiro a leitura dos dispositivos abaixo:
Lei nº 5.764, de 1971, arts. 85 a 88 e art. 111;
Lei nº 9.430, de 1996, arts. 1º e 2º;
Lei nº 9.532, de 1997, art. 69; e
RIR/1999, arts. 182 a 184.