é pergunta muito ampla, mas basicamente, você parte do lucro líquido do exercício antes do IRPJ e da CSSL.
Com base na demonstração analítica de resultados você deve identificar as despesas ou custos que por lei são indedutíveis e adicionar, ex: Multas em geral exceto as moratórias, despesas com brindes, despesas não vinculadas à atividade da empresa, impaiment, . e dezenas de outras rubricas.
Do lado da Receita, vc pode excluir as depreciações calculadas pelo regime fiscal contra as contabilizadas a menor pelas normas contábeis, subvenção para investimentos, dividendos etc
Lembre que é preciso preencher também o LCSSL
Veja basicamente o que dispõe o RIR/99 no capítulo VI da seção Lucro Real