Operação não realizada

Boa tarde, colegas!

Estou com uma situação e gostaria da ajuda dos mesmos. Compramos uma estrutura metálica de uma empresa, porém, a mesma fez a nota incorretamente, no lugar do CNPJ da Matriz ela colocou da filial. Efetuamos a operação não realizada da nota, mas o setor responsável ficou com a estrutura retida. A empresa não aceita a recusa, dizendo ser algo ilegal e que poderá sofrer com autuações futuras. A nota foi recusada como operação não realizada, existe algum modo de desfazer o evento?