PERT de Debitos DCOMP / Despacho Decisório

Bom dia prezados! A Empresa fez uma compensação onde o credito não foi reconhecido na Dcomp por despacho decisório. A empresa foi intimada a fazer o recolhimento da diferença do credito não reconhecido, esse valor poderá entrar no PERT., visto que o tributo então foi pago a menor no periodo?

Nao, pois no meu entender , por já ter sido emitido a Intimação, o melhor seria pagar logo, pois se colocar no PERT, a coisa pode degringolar, pois, são procedimentos distintos e demorados, a nao ser que o valor seja substancial, então valeria a pena fazer uma consulta por escrito. Mas nao por simples dedução do contribuinte, pois trata-se de um PERDCOMP, com despacho negatório e Intimação, isso pode acordar o Leao.
Sds. Ribeiro