Você deverá registrar em seu Ativo o Darf pago indevidamente ou a maior, registrar a variação monetária atualizado pela selic e baixar o pagamento em seu passivo normalmente, creditando o seu Ativo.
Exemplo:
DARF PAGO A MAIOR: R$ 200,00.
DARF A RECOLHER TEMPESTIVAMENTE R$ 50,00.
Selic acumulada 10,53%
Contabilização do crédito a compensar
D: PAGAMENTOS INDEVIDOS OU A MAIOR: R$ 221,06
C: DARF A RECOLHER R$ 200,00
C: VARIAÇÃO MONETÁRIA R$ 21,06
Contabilização da compensação
D: DARF A RECOLHER R$ 50,00
C: PAGAMENTOS INDEVIDOS OU A MAIOR R$ 50,00
Seu saldo original será de 154,76
Seu saldo registrado no Ativo 171,06