Nota fiscal de serviço emitente igual o destinatário

Bom dia

Tenho uma empresa em Santana de Parnaiba, na atividade de natação.

Acontece que nem todos os alunos querem a nota fiscal, o que é feito hoje emitimos uma nota fiscal do montante desses alunos que nao aceitam a nota fiscal contra a própria prefeitura temos um oficio onde nos autoriza a fazer isso.
Nesse mesmo oficio feito pela prefeitura também nos autoriza a emitir a nota fiscal contra nos mesmo ou seja emitente e destinatário.
Quero saber se esta pratica é realmente correta, se isso pode gerar problemas futuros contra outros órgãos.

Desde ja agradeço

Nao tem problema porque voces estao amparados por um documento oficial, assinado e carimbado, e como quem legisla sobre o ISS e sobre a NFs. e a prefeitura, outra entidade governamental nao poderá questionar, inclusive e de bom alvitre que se coloque na tal NFs. o numero ou outra identificação do documento oficial, assim caso ele vier a sumir, o que nao deve ocorrer, saberá como localizar o mesmo, na prefeitura.
Sds> Ribeiro