Milca, boa tarde.
Infelizmente sim, essa é a unica forma. O parcelamento atual do Simples Nacional convencional, sendo MEI ou não, é considerado um parcelamento "inteligente", que se auto consolida mesmo que você, por exemplo, pague uma guia que foi inicialmente inclusa no parcelamento.
Por isso ele possui estas característica de impossibilitar a mudança da consolidação inicial.
Uma dica que eu dou para os meus clientes é de ir pagando as guias de acordo com suas reservas. Por exemplo, cada guia do DAS-MEI é uns R$ 50,00. Dai então o cliente arranja uns R$ 300,00. Vou lá e imprimo umas 4 ou 5 guias para ele (porque terão juros) e passo para ele pagar. Pronto, menos 4 ou 5 competências em aberto.
Porém, essa atitude só pode ser tomada caso o cliente não preciso de uma regularização imediata, como, por exemplo, para liberação de CND, tendo em vista que ela não possui prazo certo para acabar.
"Nas horas difíceis, jamais baixe a cabeça, porque a solução para o problema não está no chão, mas sim na sua determinação."