Prezado Thales,
Ao fazer a escolha pelo regime de tributação, em si tratando de filial, ela deve serguir o mesmo regime tributário da matriz.
Porém ao decidir abrir uma nova empresa, deve-se avaliar uma série de fatores que vai desde o custo da sua mercadoria até o valor dos encargos sociais pagos incidentes na folha de pagamento.
Em geral, a tributação pelo simples nacional é mais vantajosa, (eu disse em geral), mas deve ser feito um estudo prévio da situação da empresa, do possível resultado da empresa e ainda dos encargos sociais.
As alíquotas do Lucro Presumido para as empresas que trabalham com compra e venda de mercadoria é:
Lucro Presumido
Pis - 0,65%
Cofins - 3,0 %
IRPF - 1,2%
CSLL - 1,08%
Total - 5,93%
Lembrando que essas alíquotas são simplesmente para os impostos federais, devendo os impostos estaduais serem calculados normalmente com a apuração de crédito e débito do imposto.
Em resumo, deve ser feito um estudo pra poder definir qual a opção mais vantajosa.
att,
Enos Pereira