Deni, bom dia!
No seu caso, você disse que gerou a guia como prestação de serviços com retenção, quando o correto seria sem retenção, certo?
Então, você gerou uma guia com valor a menor do que deveria ser.
Como você disse que a guia ja foi paga, peço que conecte-se ao PGDAS e clique em "Consulta", e depois em "Extrato", feito isso insira o mês e o ano da apuração feita incorretamente, ao abrir, desça a barra de rolagem no item 7.2 constará se o pagamento deste DAS.
Caso o pagamento já tenha sido reconhecido, é só proceder a retificação, o sistema reconhecerá automaticamente o valor que já foi pago, e será gerado apenas um DAS complementar com o valor restante.
Caso o pagamento não tenha sido reconhecido, oriento que espere tal reconhecimento e depois efetue a retificação, pois se o pagamento não tiver sido reconhecido, será gerado um novo DAS com os valores totais da apuração.
Espero ter ajudado.
Att.