arquivo exteporaneo x sped

Ola, estou com uma grande questao:

Trabalho em uma empresa que o fluxo de NF de entrada e saida é enorme e acaba ficando nota para tras devido ao atraso da entrega da mesma (obs: isto só acontece com as notas de entradas) entao pelo software que usamos eu dou entrada deste documento atrasado porem informo a situaçao EFD exteporaneo (é o correto a fazer), até ai tudo certo, mas quando vou conferir os erros do sped, ele acusa erro nesta entrada devido a informaçao exteporanea, ou seja, o sped nao esta aceitando a NF como exteporanea. Alguem tem experiencia neste problema ou tenha a solução para me ajudar? desde ja agradeço.