Olá!
Uma consultora me informou que conforme Manual de Orientação da EFD Pis/Cofins, todos os participantes, ou seja, os entes envolvidos nas transações da empresa, deverão ser cadastrados, não sendo aceito CNPJs/CPF que não sejam originais. Somente nos casos de registros representativos de operações de vendas à consumidor final (Nota Fiscal de Vendas a Consumidor Final), o que é o nosso caso, inclusive os emitidos por ECF, não precisam ser informados os campos CNPJ e CPF. Também o campo CPF não precisa ser informado, nas operações representativas de vendas de bens e serviços a pessoas físicas estrangeiras.
Entrei em contato então com os consultores do programa que usamos e eles nos orientaram a deixar a NF sem destinatário (existe uma opção para isso), orientaram tambem a mudar a opção modelo da NF para ''NF venda ao consumidor''.
Depois de mudar todos os lançamentos do mês 07/2011, gerei o arquivo, e o mesmo, que antes estava com 1 erro (o do CNPJ/CPF inválido) passou a ter 46 erros
Portanto a dúvida ainda persiste, caso eu consiga algum sucesso, volto a postar