Olá Claudio,
Somente complementando a informação do Saulo, uma outra variável importante de se verificar no caso da prestação de serviço com relação a tributação entre Lucro Real e Presumido é em relação aos créditos de Pis e Cofins.
Sua empresa pode ter um Lucro Real (contábil) inferior aos 32% do Lucro Presumido, mas por ser prestadora de serviço e adquirir pouco material poderá ter poucos créditos de Pis e Cofins. Assim no Lucro Real você poderá ser mais tributado nesses dois impostos, pois no Lucro Real as alíquotas de pis e cofins são maiores. Faça a comparação incluindo todos os tributos devidos.