duvidas sobre tributos

Boa noite. alguem ai pode me ajudar, pois abrir uma empresa pela primeira vez contratei um contador que não me instrui em nada. tirou meu cnpj e abri uma conta no banco no final de setembro.onde não emiti nota nesses 3 meses porque ainda não estava enquadrada no simples.só agora no começo de janeiro que fui enquadrada no simples, e meu contador somente me avisa agora que vou ter que pagar os 18% para a receita,isso é um absurdo nem bem abri vou ter que quebra para pagar o imposto por falta de informação.existe a possibilidade de zera este imposto,dos meses de outubro novembro e dezembro ? pois só me enquadrei no simples agora em janeiro

Houve atividade nesse período entre Setembro e Janeiro? Se não houve atividade, basta fazer uma declaração de Inatividade.